Om een vlotte en veilige scheepvaart op de Schelde en haar aanloopgebieden in zee te garanderen, werken Vlaanderen en Nederland samen. De GNA zorgt dagelijks voor veilig en vlot scheepvaartverkeer. Een nautische aansturing over de verkeersstroom wordt verzekerd door een goede samenwerking tussen alle diensten die bij het scheepvaartgebeuren betrokken zijn.
De kern van de GNA bestaat uit 7 hoofdverkeersleiders GNA van het Waterdistrict Westerschelde (voorheen Scheepvaartdienst Westerschelde) en 7 chef-loodsen (nautisch dienstchefs) GNA van de afdeling Scheepvaartbegeleiding.