IMIS - Marine Onderzoeksgroepen | Compendium Kust en Zee

IMIS - Marine Onderzoeksgroepen

[ meld een fout in dit record ] Print deze pagina

Genomische variatie in de zeebaars: van SNP ontdekking in ESTs tot een genoomscan
www.kuleuven.be/onderzoek/onderzoeksdatabank/project/3E05/3E050634.htm
Engelstalige titel: Genomic variation in European sea bass: from SNP discovery within ESTs to genome scan
Identifier financieringsorganisatie: 3E050634 (Other contract id)
Periode: Oktober 2004 tot Oktober 2008
Status: Afgelopen

Thesaurustermen: Bioinformatics; Evolutie; Selection; Vis
  • Katholieke Universiteit Leuven; Departement Biologie; Afdeling Dierenecologie en -systematiek; Diversiteit en Systematiek van Dieren, meer, coördinator
Algemeen doel is de identificatie van genen die geassocieerd zijn met selectie in wilde populaties van zeebaars. Daartoe wordt in een databank van 30,000 Expressed Sequence Tags van zeebaars gezocht naar Single Nucleotide Polymorfismen met bioinformatische methodes. De potentiële merkers worden gevalideerd in het laboratorium. Vervolgens zullen een Noordzee en Middellandse Zee populatie getoetst worden voor neutrale en adaptieve evolutie op basis van een genoomscan.